永磁电机过载运行，主要原因是由于拖动的负载过大，电压过低，或被带动的机械卡滞等造成。若过载时间过长，永磁电机将从电网中吸收大量的有功功率，电流增大，温度上升，在高温下永磁电机的绝缘便老化，磁钢失磁。因此，永磁电机在运行中，要注意经常检查传动装置运转是否灵活、可靠；联轴器的同心度是否标准；齿轮传动的灵活性等情况。若发现有滞卡现象，应立即停机查明原因排除故障后再运行。
三相交流永磁电机，其三相电流任何一相电流与其他两电流平均值之差不允许超过10%，这样才能保持永磁电机安全运行，如果超过则表明永磁电机有故障，必须查明。
检查永磁电机的温度要经常检查永磁电机的轴承、定子、外壳等部位的温度有无异常变化。
永磁电机轴承是否过热，缺油，若发现轴承附近的温升过高，就应立即停机检查，轴承的滚动体、滚道表面有无裂纹、划伤或缺损，轴承间隙是否过大晃动，内环在轴上有无转动等。出现上述任何一种现象，都必须更新轴承后方可再进行工作。
观察永磁电机有无振动、噪声大，永磁电机若出现振动，会引起与之相连接的负载部分不同心度，形成永磁电机负载增大，出现超负荷运行，就会烧毁电机。因此，永磁电机在运行中，尤其大功率永磁电机更需经常检查地脚螺栓、端盖、轴承压盖等是否松动，接地装置是否可靠，发现问题及时解决。

保持永磁电机的清洁，永磁电机在运行中，进风周围至少3m内不允许有尘土、水渍和其他杂物，以防止吸入电机内部，形成短路介质，或损坏导线绝缘，造成短路，烧毁电机，所以，要确保永磁电机有足够的绝缘电阻，以及良好的通风冷却环境，才能使永磁电机在长时间运行中保持安全稳定的工作状态。